home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00795 < prev   
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.7 KB  |  55 lines
  1. ************************************************************
  2. * PTS EIIB domains cysteine phosphorylation site signature *
  3. ************************************************************
  4.  
  5. The phosphoenolpyruvate-dependent sugar  phosphotransferase system (PTS) [1,2]
  6. is a major  carbohydrate  transport system  in  bacteria.  The  PTS  catalyzes
  7. the  phosphorylation of  incoming  sugar  substrates  concomitant  with  their
  8. translocation across the cell membrane.    The general mechanism of the PTS is
  9. the  following:  a  phosphoryl   group  from   phosphoenolpyruvate   (PEP)  is
  10. transferred  to  enzyme-I  (EI)  of  PTS  which  in  turn  transfers  it  to a
  11. phosphoryl carrier protein (HPr).  Phospho-HPr  then transfers  the phosphoryl
  12. group  to  a  sugar-specific  permease   which  consists  of  at  least  three
  13. structurally distinct  domains (IIA, IIB, and IIC) [3]  which  can  either  be
  14. fused together  in  a  single  polypeptide chain  or  exist as  two  or  three
  15. interactive chains; which used to be called enzymes II (EII) and III (EIII).
  16.  
  17. The first domain (IIA),  carries  the  first  permease-specific phoshorylation
  18. site, an  histidine which is  phosphorylated by phospho-HPr. The second domain
  19. (IIB) is phosphorylated on a cysteinyl or  histidyl residue,  depending on the
  20. permease, by phospho-IIA. Finally the phosphoryl group is transferred from the
  21. IIB domain to the sugar substrate in a process  that  is  catalyzed by the IIC
  22. domain; this process is  coupled to  the transmembrane transport of the sugar.
  23.  
  24. The region  around  the phosphorylated cysteine of some PTS components is well
  25. conserved and  can  be  used  [4] as a signature pattern for the following IIB
  26. domains:
  27.  
  28.  - Arbutin-, cellobiose- and salicin-specific; IIB(Asc).
  29.  - Beta-glucosides-specific; IIB(Bgl).
  30.  - Glucose-specific; IIB(Glc).
  31.  - N-acetylglucosamine-specific; IIB(Nag).
  32.  - Sucrose-specific; IIB(Scr).
  33.  - Maltose and glucose-specific (gene malX).
  34.  - Escherichia coli arbutin-like (gene glvB).
  35.  - Bacillus subtilis sacX.
  36.  
  37. -Consensus pattern: N-[LIVMFY]-x(5)-C-x-T-R-[LIVMF]-x-[LIVMF]-x-[LIVM]-x-D
  38.                     [C is phosphorylated]
  39. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  40. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  41.  
  42. -Expert(s) to contact by email: Reizer J.
  43.                                 jreizer@ucsd.edu
  44.  
  45. -Last update: June 1994 / First entry.
  46.  
  47. [ 1] Postma P.W., Lengeler J.W., Jacobson G.R.
  48.      Microbiol. Rev. 57:543-594(1993).
  49. [ 2] Meadow N.D., Fox D.K., Roseman S.
  50.      Annu. Rev. Biochem. 59:497-542(1990).
  51. [ 3] Saier M.H. Jr., Reizer J.
  52.      J. Bacteriol. 174:1433-1438(1992).
  53. [ 4] Reizer J., Michotey V., Reizer A., Saier M.H. Jr.
  54.      Protein Sci. 3:440-450(1994).
  55.